合作信息
生物医药高性能并行计算及创新应用平台
发布单位:南开大学
所属行业:电子信息、新一代信息技术
合作信息类型:意向合作
机构类型:高等院校
供求关系:供应
合作信息期限:2016-12
参考价格:面议
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合作信息简介
数学院 梁科 信息 邵秀丽
生物医药的发展遇到计算性能达不到规模要求的瓶颈,该项目选择以生物医药学相关算法的高性能并行计算为目标,利用高性能并行计算系统,对生物医药进行了深入的研究。利用现代生物及化学信息学手段开展了抗病毒药物的设计工作,其中包括SARS,HIV以及广谱药物的研究。拥有自主开发的于模代数理论的快速大规模多重比对算法SMA。在计算机药物设计方面,开发了DDS—SIM模块中具有自主知识产权的算法,并拥有一套小分子和已有药物化合物的结构和生物特性的化学数据库。
创新点:
1.利用高性能并行计算系统所开发的应用系统"基于WEB的超算服务平台"设计思路新颖合理,实现了集群监控,用户可直接通过公共服务平台调用超算;
2.在肿瘤基因的研究方面,自主开发基于模代数理论的多重比对算法SMA。在比对规模、计算速度与优化指标等性质明显优于现有的多重比对软件包;
3.构建了制剂成品率与制剂工艺参数间的非线性模型,并寻优。建设了中药生产质量优化控制并行计算、分析和服务平台,支持中药生产质量的优化控制。
取得的成效:
该项目部分成果在天津市天和医院的"SIRS与MODS"研究中应用,并成功地实施了“痹祺胶囊传统工艺流程优化”、“京万红传统工艺流程优化”、“精制银翘解毒片生产线设备参数优化”以及“中药滴丸制剂过程建模、优化及应用研究”等项目的研发,取得了明显的经济效益和有重大实用价值的成果。
该项目获2006年度天津市科学技术进步奖二等奖。
生物医药的发展遇到计算性能达不到规模要求的瓶颈,该项目选择以生物医药学相关算法的高性能并行计算为目标,利用高性能并行计算系统,对生物医药进行了深入的研究。利用现代生物及化学信息学手段开展了抗病毒药物的设计工作,其中包括SARS,HIV以及广谱药物的研究。拥有自主开发的于模代数理论的快速大规模多重比对算法SMA。在计算机药物设计方面,开发了DDS—SIM模块中具有自主知识产权的算法,并拥有一套小分子和已有药物化合物的结构和生物特性的化学数据库。
创新点:
1.利用高性能并行计算系统所开发的应用系统"基于WEB的超算服务平台"设计思路新颖合理,实现了集群监控,用户可直接通过公共服务平台调用超算;
2.在肿瘤基因的研究方面,自主开发基于模代数理论的多重比对算法SMA。在比对规模、计算速度与优化指标等性质明显优于现有的多重比对软件包;
3.构建了制剂成品率与制剂工艺参数间的非线性模型,并寻优。建设了中药生产质量优化控制并行计算、分析和服务平台,支持中药生产质量的优化控制。
取得的成效:
该项目部分成果在天津市天和医院的"SIRS与MODS"研究中应用,并成功地实施了“痹祺胶囊传统工艺流程优化”、“京万红传统工艺流程优化”、“精制银翘解毒片生产线设备参数优化”以及“中药滴丸制剂过程建模、优化及应用研究”等项目的研发,取得了明显的经济效益和有重大实用价值的成果。
该项目获2006年度天津市科学技术进步奖二等奖。