主要针对部队平、战时各种环境和劳动因素对指战员健康和作战能力的影响，开展以提高部队平战时卫生水平和作战能力为中心的卫生保障措施的研究。该所设有劳动卫生、环境卫生、营养卫生、高原医学、寒区卫生、卫生检验、病理等研究室。完成国家和军队下达的500多项研究任务，在军事劳动卫生、饮水卫生、营养学、高原和寒区卫生等研究方面做出了突出成绩。获得国家和军队科技成果奖80多项。主办了《中国应用生理学杂志》、《营养学报》和《解放军预防医学杂志》等全国性刊物。