研究所具有先进的系统电磁兼容设计能力，2000年开始承担大型电子信息系统的全系统电磁兼容设计，陆续完成29项设计任务，开发了多北京航空航天大学科研推广项目汇编     套独具特色的电磁兼容性软件，突破了国外技术垄断的状况。已申请国防专利和发明专利11项、著作权3项，曾获国家科技进步二等奖1项（2007）、国防科学技术一等奖2项（2006、2010）。自主研发的系统级电磁兼容设计软件解决了复杂电子产品的电磁兼容特性难以仿真分析设计、制定和分配系统级电磁兼容指标的难题，可进行完备的系统行为级仿真。